Hideki Kamiya ha dichiarato che The Wonderful 101 era stato originariamente pensato come un titolo che includesse al suo interno tutti i personaggi delle saghe Nintendo.
Kamiya ha spiegato che inserendo dei personaggi così famossi in uno stesso titolo si sarebbero potuti accontentare alcuni videogiocatori, scontentandone invece altri.
Di qui la scelta di rendere tutti contenti con personaggi completamente nuovi, mai visti dal pubblico.